Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd8P23463 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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