Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja1P23242 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms