Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RarbP22605 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RarbP22605 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RarbP22605 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms