Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk1P22518 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk1P22518 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms