Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gna11P21278 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms