Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms