Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms