Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps6ka3P18654 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms