Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps6ka1P18653 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms