Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P18530 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P18530 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P18530 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P18530 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P18530 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
P18530 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P18530 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P18530 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P18530 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P18530 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P18530 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
P18530 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P18530 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P18530 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P18530 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P18530 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms