Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms