Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms