Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms