Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb1P13372 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms