Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx1P13297 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx1P13297 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx1P13297 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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