Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrm1P12657 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms