Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DmdP11531 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DmdP11531 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DmdP11531 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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DmdP11531 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DmdP11531 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DmdP11531 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DmdP11531 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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DmdP11531 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DmdP11531 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DmdP11531 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DmdP11531 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DmdP11531 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DmdP11531 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DmdP11531 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DmdP11531 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DmdP11531 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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DmdP11531 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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DmdP11531 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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DmdP11531 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DmdP11531 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms