Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms