Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms