Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf1P09925 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf1P09925 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf1P09925 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms