Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifna9P09235 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms