Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb7P09024 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms