Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NefmP08553 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefmP08553 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NefmP08553 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefmP08553 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefmP08553 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefmP08553 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefmP08553 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefmP08553 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefmP08553 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefmP08553 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NefmP08553 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NefmP08553 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NefmP08553 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NefmP08553 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NefmP08553 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms