Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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