Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Spta1P08032 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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