Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtrP07309 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtrP07309 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtrP07309 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtrP07309 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtrP07309 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtrP07309 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtrP07309 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtrP07309 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtrP07309 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtrP07309 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtrP07309 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtrP07309 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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