Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P06335 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P06335 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06335 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06335 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06335 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06335 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06335 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms