Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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