Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01648 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01648 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01648 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01648 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01648 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01648 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01648 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01648 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01648 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms