Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01636 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01636 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01636 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01636 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01636 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P01636 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01636 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01636 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms