Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms