Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl2O89104 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms