Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn2O88703 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms