Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AvilO88398 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AvilO88398 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AvilO88398 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AvilO88398 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AvilO88398 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AvilO88398 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AvilO88398 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms