Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt1O88346 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms