Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cfdp1O88271 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cfdp1O88271 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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