Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Psma3O70435 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms