Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Lnx1O70263 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Lnx1O70263 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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