Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms