Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkbO70126 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkbO70126 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms