Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms