Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptpn20O55082 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn20O55082 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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