Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LatO54957 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LatO54957 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LatO54957 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LatO54957 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LatO54957 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LatO54957 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LatO54957 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LatO54957 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LatO54957 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LatO54957 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LatO54957 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LatO54957 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LatO54957 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LatO54957 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LatO54957 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LatO54957 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LatO54957 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms