Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms