Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CrxO54751 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CrxO54751 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CrxO54751 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CrxO54751 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CrxO54751 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CrxO54751 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CrxO54751 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CrxO54751 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CrxO54751 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CrxO54751 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms