Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bnc1O35914 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bnc1O35914 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bnc1O35914 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Bnc1O35914 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Bnc1O35914 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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