Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timm44O35857 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms