Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RaxO35602 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RaxO35602 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RaxO35602 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RaxO35602 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RaxO35602 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RaxO35602 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RaxO35602 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RaxO35602 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RaxO35602 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaxO35602 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaxO35602 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaxO35602 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaxO35602 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaxO35602 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaxO35602 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaxO35602 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RaxO35602 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms