Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Opn1mwO35599 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Opn1mwO35599 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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