Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccrl2O35457 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccrl2O35457 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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